現時点ではキメラブロックスは「無人機」ですが共和国無人ブロックスは凱龍輝のオプション（というかファンネル）のようなものだと思っています。自動的に敵と戦うキメラと違い、月甲と飛燕は凱龍輝の指令で「動くもの」でありいささか意味合いがちがっていると思うのです。
ですから本当の意味での無人機同士の戦いはまだ起きないはず。

とすればキメラと共和国ゾイドの戦いがケースパターンになるのですが・・。
葵さんのおっしゃる通りキメラの性能は低いと思います。臨機応変の有人ゾイドに対し、キメラは与えられた命令に従うのみだし、ロードゲイル等の指令機からの命令のタイムラグもあります。しかし。
シュトルヒのバトストでは一機（おそらくエースパイロット）を除いてレイノス部隊は壊滅しています。
コストが安くて特攻ができるキメラは一般のパイロットたちには恐ろしい相手だと思います。（かつてのザバットのように）。
地上戦でも同じ状況は生まれるはずです。
まだ戦力の少ない新ゼネには実に都合が良く、キメラを量産すれば新ゼネの総戦力も一応高くなります。とすれば
国家としての駆け引きにも重要なものになっているのでは？