ゾイドの作品として見るか、飽くまでアニメの一つとしてみるかで評価は分かれるでしょうが、自分は好きですよ。

作画やCGについては…2クール目から改善されるという噂を信じましょう(＾＾；
…あれは作画だけだったかな？(汗)

｢丁寧な脚本｣
確かに言葉にすればこれだけです。
…では、実際に書いてみてください。
滅茶苦茶難しいですから。
…いやまぁ、私は小説の構想しかやったことないんですが(ぉ

でも、ありきたりな話こそ脚本家の手腕が求められるような気がするんですけどね。

＞設定
ゾイダーなら気付く設定ミスは、所詮ゾイダーしか気付きません。
アニメはゾイダーに受けるために作られているのではなく、ゾイドをより多くの人に知ってもらい…ぶっちゃけて言えば、ゾイドの売り上げを伸ばす為に作られているのです。
我々は元々の設定を知っている為、以前の情報との相違があればそれぞれがその設定を補完する事が出来ます。
しかし、それができない人にとっては詳しい設定など蛇足でしかありません。
特にこれは基本的に子供向けの作品ですから、詳細な設定よりもフィーリングで感じる事の出来る設定の方が向いているでしょう。
設定がきっちりしている作品が必ずしも良い作品であるとは限らないのですよ。
ある程度想像の余地が残されていてこそ、視聴者もそこを楽しむことが出来るのではないでしょうか。
と言うか、ゾイドシリーズはそれそのものですし。

キャラが気に入らないのは…まぁ、これも人それぞれ。
しかし、物語を進めるのは飽くまでも人間。
どのような形であれ、彼らに魅力がなければ物語に引き込むのは難しいですよ。
商売気を出すなら、キャラが好きで玩具を買う人も見込めますしね。

色々書きましたが、最後に一言。
｢気に入らないなら見ないことです。｣