ゾイドは生命体だから意志があるんですよ。

戦闘用ゾイドはゾイドコア以外の部分を完全に人工パーツで置き換えて作るのですが、ゾイドコアには地球の生命で言う内蔵部が全て凝縮されています。Ziの技術では、OS等でコアの出力を高めることは可能でも、内部の情報を操作することは出来ないのではないでしょうか？イグアンのコアにデスザウラーになれって言った手無理な話ですから。これは本題とは関係ないことですけど。

＞ブロックスの意志
ブロックスが意志を持つというのは電ホビ設定であって、公式設定ではないのではないですか？私が公式設定と認めるのは、ファンブックに書かれていることだけなんですが。（あくまでも私だけ）
それは置いておいて。

意志があるというのは、実戦に置いても高い戦闘力を発揮するために必要なものではないでしょうか？
パイロットとの精神リンクにより、飛躍的にその反応速度などが上昇するのは周知の事実。操縦桿さえ必要としない時だってあります。
やはり、只の人間の操り人形より意志のあるゾイドの方が遙かに反応速度は高いものだと思います。
地球人は、惑星Ziに降り立つ際に、反物質による対極消滅エンジンという超技術を持っていたわけですが、それでも彼らはゾイドの力を見込んだということから、人が操縦するロボットよりも遙かに優れた能力があったと言うことではないでしょうか？

そもそも、意志がなければゾイドではないのではないかという疑問が沸いたのですが。某バクゥみたいです。