んー・・・、確かに細々とした矛盾点は見受けられますので、思いきった意見を出してみようと思います。

１：凱龍輝

　凱龍輝のコンセプトは『足し算』と言われているところからして、おそらくＢＬＯＸコアはただの補助動力源として運用していたのでは無いでしょうか？　そのため、凱龍輝コアと密接にシンクロさせる必要が無く、負担もそれほど無かったとか。　セイスモサウルスも似たような理由で大丈夫だったかもしれませんねぇ。

２：ゼロ・ファルコンとエナジーライガー

　と言う訳で妄想的意見です！（ｗ

　ライガーゼロ用サポートＢＬＯＸジェットファルコンは、各武装を１００％稼動させるために膨大なエネルギーを必要としていた。　もともとエナジーライガー用に設計されていたために、それらのエネルギーをエナジーライガーのエナジーチャージャーで賄う予定であった。
　しかし、急遽共和国側ライガーゼロとの合体に仕様が変更され、さらに改良期間として与えられた時間が短かったため『燃費の悪い』まま共和国軍に納品されたのであった。
　強力なゾイド核をもつライガーゼロは辛うじて必要なエネルギーを供給できたが、それはゼロの限界を越える出力であった。　既にフェニックスとの合体運用によって負担を強いられていたゼロ核にとって、この合体運用は致命的な一撃となり、大戦後にファルコンと合体していなかったごく一部の機体を除いて全てがコア崩壊によって死滅していったのであった。

　以上、妄想でしたｗ
　なお、エナジーライガーに関しては、ガイロス帝国から引き継いだ（強奪した？）『共和国より５年進んだ技術』と『ＺＯＩＴＥＣから提供された技術』によって、ゾイド核自体に強化改造が施されていたと、勝手に妄想していたりしますｗ