Ｚｉ−ユニゾンに関しては、単純にコアが増えたことによる出力アップの可能性もあると思います。機体の動力源が２つに増えれば、その分機体に流れるエネルギーも増えるわけで、当然負荷も増加することになりますから、制限時間が設けられても不思議ではありません。電池は１本より２本の方がパワーが出ますが、その分発熱も増える、みたいなものでは。

ゾイドコアの共振による出力アップの技術はゼロフェニックスで初めて投入されたシステム（掛け算のシステムと表現されます）で、凱龍輝のＢ−ＣＡＳは装甲部の分離、合体により運用の幅を増すもの（足し算のシステムと表現されます）です。ですから凱龍輝には制限時間は存在しないと思います。その分パワーも並みのままだと思いますが。

防御力に関しては、合体によって上がるかは、まだ分からないと思います。合体前にダメージを与えた攻撃が、合体後には効かなかったという表現は劇中でまだなされていないですから。

「合体したゾイドには絶対に勝てない」ですが、これは大げさに言っているだけだと思います。ただ、同クラスならば、合体したゾイドは合体していないゾイドより圧倒的に有利ではあると思います。
ゾイドバトルではゾイドの最大の急所であるコクピットへの攻撃が出来ない（いくらなんでも禁止されている筈です）と思いますので、ラッキーヒットが出にくいでしょうから、ゾイドの力の差が勝敗の決め手になりやすいでしょう（第一話でマジカルステッパーズはどうやって勝つ気だったんですかね）
もちろん乗り手の腕も重要な要因だと思います。