ゾイドはどんな小さな機体でもその素となる野生体を捕獲もしくは養殖して、その種類に応じた機体を製造することになります。
対するBLOXは完全人工物であるためにその過程が省かれる上、恐らくはプログラムによりどんな種類の動きでも再現することが出来ると考えられます。
同じ生産ラインで製造したBLOXなら性能差もほとんどなく、意思を持つゾイドよりも扱いやすいでしょう。
それらを考慮すれば、汎用性・生産性はBLOXの方が圧倒的に上でしょうね。

但し、所詮はプログラムによって動きを再現したに過ぎない訳ですから、出力や運動性などはゾイドには劣るでしょう。
パイロットとの相性もないので、スペック以上の性能は出せませんし。
単純な戦闘力ではゾイドにかなうべくもない…はずなんですけどね(−−；
まぁ、TOMYの売り文句やコロコロの記事は聞き流すとしまして…

｢戦争は数だぜ、兄貴｣とどこかの誰かが言っていた様に、性能差がなく、数も比較的容易に揃えることが出来るBLOXは軍上層部にとっては非常に扱いやすいものだったのでしょう。
ゾイドに乗りたい兵士は多いでしょうから、擬似的にでもそれをかなえることの出来るBLOXの導入は士気の向上にもつながるでしょうし。

以上から、｢ゾイドは戦闘力が高く、BLOXは戦略的に強い｣と考えております。