ファンブック１に『共和国にくらべ、５年は進んでいるといわれる帝国の技術力。』とあるのでガイロス帝国とヘリック共和国とのＯＳ技術の格差は、それ以上あるのかもしれませんね。
ヘリック共和国のＯＳ技術は情報部による入手情報と亡命科学者によって始まった技術であり、
帝国にくらべ共和国のＯＳ技術は基礎研究が脆弱で背伸びした技術（レベル以上の技術）であったのではないでしょうか。
当時、ＯＳは既存ゾイド（旧ゾイド）の能力強化をも含めた夢の超技術でもあったといえます。
共和国は莫大な予算と科学者や技術者を動員して帝国のＯＳ技術に追いつけ、追い越せで精進したと思います。
しかし、その技術格差は中々縮まるモノではなかったのでしょう。

共和国のＯＳゾイドを俺的に再考察・・・・・・
ブレードライガー・・・・・・もともとＯＳゾイドとして設計されたのではなく新技術を新型ゾイドに試験的に載せたゾイド。結果は良好？ＯＳレベルはそれほど高くない。
ＧＴＯ・・・・・・共和国製ＯＳゾイド第２号、ＯＳレベルは高い。制御不能の失敗作。
ストームソーダー・・・・・・ジェノと競作だった元・帝国ゾイド。ＯＳ技術的には未解析、未熟を抱えた欠陥機。制空権奪還と反撃の為に早期より無理を承知で量産。
ガンスナイパー・・・・・・量産型ＯＳゾイド。ＯＳレベルは最低。射撃武器中心というのはＯＳの特筆効果を活かしていないような・・・・・・重武装でも軽快さとスタミナがウリなのか？

共和国ＯＳゾイドは帝国ＯＳゾイドとは違った方向性で武装していますね。共和国は重武装・重装備によってＯＳ核に負荷をかけて制御を容易にしているのかもしれません。
ＯＳ核を上手く制御しきれていないか、ＯＳ核から生み出される膨大なエネルギーを持て余しているのではないでしょうか。
ゆえに重く高出力な兵器システムを持たされたのでしょう。それがまた強さの秘密？

ファンブック２以降、共和国製ＯＳゾイドが途絶えています。
デスステンガーの暴走事件や、ＯＳはゾイドの心を無理にねじまげ、強制的に狂暴化させる酷い技術というゾイド愛護論とされていますがそんな事で研究開発を中止するでしょうか？
妄想・・・・・・共和国軍はＯＳゾイド開発を中止するような致命的で悲惨で痛い目にあっている。

ＺＡＣ2100年４月には制空権奪還のためにストームソーダーをイキナリ２００機投入しています。
共和国の工業力の凄さといえばそうですが、十分なテストとパイロットに対するＯＳゾイドの精神汚染が克服されていたのでしょうか？
戦果はＳＳの圧勝。しかし以後、ＳＳの活躍がありません。ウルトラの護衛に配属されていたようですがか同在のカットが無く、ニクシー基地大空襲という一大事にすら姿がありません。ＳＳは何処へいったのでしょうか？
ＳＳによるバイオハザードの発生。
ゾイドにはパイロットと精神を共有する精神リンクがあります。
多くの若いパイロット達は最新鋭で最強のゾイドとの一体感に酔いしれた。
そして、パイロット達は廃人（精神異常・人格崩壊ete）へ・・・・・・
軍は緘口令を引いたでしょうが人の口に戸は立てられませんし、一応は文民国家ですから情報統制と隠蔽には無理があるでしょう。
戦いではなく欠陥ゾイドで息子を失なったとあっては遺族や国民に申し開きができません。
以後、先行してＯＳゾイドを配備した共和国空軍の弱体化は尾を引いています。
共和国はＯＳの正体と恐怖を身をもって知たのでしょう。

共和国のＯＳ技術の程度は判りませんが、帝国よりは劣っている事は確かでしょう。
もともと富める国であるヘリック共和国にとってＯＳ技術は危険を冒してまで完成させる技術でもなかったのかもしれなせん。
ＯＳ量産にしても出来る出来ないはともかく、技術的に未熟で不完全な技術よりは既存既製の技術による生産／開発をするでしょう。
限られた資源から超兵器志向にならざるおえない帝国軍とは違いますからね。