マッドとギガの汎用性
ギガにはブロックスマウントのおかげで、いくらでもブロックスを追加武装出来ますが、マッドは背中のビームキャノンしかありません。地形適応力は、ほんのちょい、ギガが上です。
量産性
完全野生体ベースの機体は生産コストが高いそうで（ゼロはブレードの３倍でしたっけ？）アロのバトストで無理に量産したため、小型ゾイドにまでやられるという・・・。この点では、OSで量産可能なマッドの方がいいのかもしれません。ストームソーダーが量産出来ないのはコアそのものがないんでしょうか？

両者の直接対決
ギガもマッドも格闘戦がなんぼの機体なので、当然殴り合いになるわけですが、ギガには不利では？
正面から突っ込んでいけば、マグネーザーの餌食ですし、武装して砲撃するにしても、敵は超重装甲＆シールドです。（全てのブロックスの武器を装備してもダメージが与えられるかどうか怪しいもんだ）
メガンテすればさすがに倒せそうですが、それではダメですし。