面白そうな企画ですね〜。
ゾイドファン達の意見を出し合ってストーリー等を構成すれば、今までの不満が無い作品が完成するかもしれません。

私としてはアニメを是非制作して欲しいですね。
でもアニメは難易度が高いのでウエブコミックみたいなものでも良いかも・・・と思ったりしています。

少数派かもしれませんが、私は戦争モノを希望しています。ジャンルの特性上、死についての描写はどうしても避けがたいものになってしまいますが、ハードな物語（ゾイドの兵器面を強く押し出す事や、複雑な人間・政治関係を描いたもの）を見てみたいですね（暗い雰囲気になりかねないですが）　

・・・勿論ゾイドバトルも良いです、見た後の気分の良さではこちらですし、ゾイドバトルにするならリアル路線を多少犠牲にしてでも、爽快性を強く押し出したものが良いですね。（一言で言えば“ど派手なゾイドバトル”です）

個人的な主張ばかりで申し訳ございません。
この企画、実現してくれればなぁ・・・・。