人型のゾイドやBLOXがあったとして、外見がガ○ダムなどの人型ロボとほとんど変わらないですから、ゾイドとしての魅力が半減するからではないでしょうか？
また、残念ながらネームバリューではそういったものと絶対的に差がある以上、同じ人型ではZOIDSという商品が埋もれてしまうという危惧もあると思います。
…というのが玩具としてタブー視されている理由だと思います。

バトスト上の理由としては、仮にゾイドコアを持つ人型の金属生命体がいたとして…普通の感性を持つ人が、ゾイドに「改造」しようと思うでしょうか？
とまぁ、そういうことではないかと。